Centrum pro komplexní molekulární systémy a biomolekuly,
Ústav fyzikální biologie Jihočeské university v Českých Budějovicích,
Česká a Slovenská krystalografická společnost a
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR
pořádají
III. Setkání českých a slovenských strukturních biologů
čtvrtek 11. března – sobota 13. března 2004, Nový zámek v Nových Hradech
III. Setkání strukturních biologů je pořádáno s laskavou podporou firmy ZeNTIVA
Abstracts of the talks and posters
Program
Čtvrtek 11. března
11:00 – 15:00 Registrace
15:00 – 15:10 Zahájení
15:10 – 16:50 První blok přednášek, předsedající R. Hrabal
Radek Kužel: Some recent non-traditional applications of X-ray scattering techniques in biology (*)
Rudiger Ettrich: Computer modelling in comparison with X-ray diffraction and NMR – Three methods and their results on the example of NaKATPase
Peter Flecker: Dissecting the role of disulfide bonds for folding and enzyme-inhibitory activity of the Bowman-Birk inhibitor
František Pavelčík: Automatic interpretation of electron density maps (*)
16:50 – 17:10 Přestávka
17:10 – 18:15 Plenární přednáška
Ing. Josef Fulka Dr.Sc.: Mammalian cloning: From Dolly to embryonic stem cells
18:30 – 23:00 Recepce
Pátek 12. března
7:00 – 8:45 Snídaně
9:00 – 10:40 Druhý blok přednášek, předsedající B. Schneider
Naďa Špačková: Combination of molecular dynamics simulations and thermodynamics analysis: Insights into the guanine quadruplex formation and DNA – drug interactions (*)
Filip Rázga: Dynamics of flexible RNA hinges relevant to ribosome function: Non-Watson-Crick basepairs, modular building and specific hydration of RNA kink-turns (*)
Peter Mojzeš: Copper porphyrins as structural and conformational probes of nucleic acids
Ivan Barvík: MD simulations highlight the ability of antisense nucleic acids to hybridize with the target mRNA sequence and their potency to elicit RNase H activity
10:40 – 11:00 Přestávka
11:00 – 12:30 Třetí blok přednášek, předsedající B. Schneider
Iva Kutá-Smatanová: Membrane protein complexes from Pisum sativum
Jiří Brynda: A phenylnorstatine inhibitor binding to HIV-1 protease: Geometry, protonation and subsite-pocket interactions analyzed at atomic resolution (*)
Tereza Skálová: Beta-galactosidase from psychrotrophic microorganism (strain Arthrobacter)
Marta Monincová: Substrate specificity of haloalkane dehalogenases
12:45 – 13:45 Oběd
14:00 – 15:40 Čtvrtý blok přednášek, předsedající J. Brynda
Richard Hrabal: A relationship between single point mutation of the matrix protein from Mason-Pfizer Monkey virus and its 3D structure
Dalibor Štys: Structural measurement of membrane protein psbH
Lukáš Žídek: Dynamics of major urinary protein I studied by NMR relaxation and molecular dynamics simulation
Josef Kapitán: Raman optical activity of small peptides and zwitterionic amino acids
Radovan Dvorský: Rho GTPases and molecular modeling
15:40 – 16:10 Přestávka
16:10 – 17:30 Pátý blok přednášek, předsedající J. Brynda
Michal Otyepka: Statistical evaluation of the near attack conformers population
Vladimír Sychrovský: Determination of the binding motif of metal cations Mg2+, Zn2+ with guanine by means of NMR spectra
Jana Přecechtělová: Theoretical Study of 31P Chemical Shielding Tensors in B-DNA
Petr Bouř: Simulation of the vibrational circular dichroism for nucleic acids
17:45 – 18:45 Večeře
19:00 – 22:00 Prohlídka posterů
Sobota 13. března
7:00 – 9:15 Snídaně
9:30 – 10:30 Pátý blok přednášek, předsedající N. Špačková
Imrich Barák: Bacterial cell division proteins – structure and function (*)
Lada Bendová: A significance of hydrophobic clusters in proteins – case of rubredoxin (*)
Petr Man: The importance of having glycosylated cleavable propeptide: the story of beta-N-acetylhexosaminidase
10:30 – 11:00 Přestávka
11:00 – 12:00 Druhý blok přednášek, předsedající N. Špačková
Bohdan Schneider: Classes of RNA conformations (*)
Jaroslav Weiser: Is EF-Tu as a well-understood bacterial molecular switch still a puzzle for structural biologists? (*)
12:00 – 12:15 Zakončení
12:30 – 14:00 Oběd
Došlé abstrakty přednášek a posterů
Třicetiminutové přednášky jsou označeny (*), ostatní jsou dvacetiminutové